MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4415532920 · doi:10.70962/jhi.20250149

The seven enigmas of SARS-CoV-2: From the past to the future

2025· article· en· W4415532920 sur OpenAlexafffund
Evangelos Andreakos, Lisa M. Arkin, Paul Bastard, Alexandre Bolze, A. Borghesi, Petter Brodin, Jean‐Laurent Casanova, Giorgio Casari, Aurélie Cobat, Beth A. Drolet, Jacques Fellay, Elena W.Y. Hsieh, Isabelle Meyts, Trine H. Mogensen, Vanessa Sancho‐Shimizu, András N. Spaan, Helen C. Su, Donald C. Vinh, Ahmad Yatim, Qian Zhang, Shen‐Ying Zhang, Laurent Abel, Alessandro Aiuti, Saleh Al‐Muhsen, Andrés A. Arias, Hagit Baris Feldman, Anastasiia Bondarenko, Ahmed Aziz Bousfiha, John Christodoulou, Roger Colobrán, Antonio Condino-Neto, Stefan N. Constantinescu, Munis Dündar, Sara Elva Espinosa‐Padilla, Carlos Flores, Antoine Froidure, Guy Gorochov, David Hagin, Rabih Halwani, Lennart Hammarström, Yuval Itan, Emmanuelle Jouanguy, Elżbieta Kaja, Yu-Lung Lau, Davood Mansouri, László Maródi, Lisa F. P. Ng, Antonio Novelli, Giuseppe Novelli, Satoshi Okada, Keisuke Okamoto, Fırat Özçelik, Qiang Pan‐Hammarström, Rebeca Pérez de Diego, David S. Perlin, Anne Puel, Aurora Pujol, Laurent Rénia, Mohammad Shahrooei, Anna Shcherbina, Ondřej Slabý, Pere Soler‐Palacín, Ivan Tancevski, Stuart G. Tangye, Ahmad Abou Tayoun, Christian W. Thorball, Pierre Tiberghien, Stuart E. Turvey

Notice bibliographique

RevueJournal of Human Immunity · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensMcGill University Health CentreInstitute of Infection and ImmunityHospital for Sick ChildrenUniversity Hospital Foundation
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteStaatssekretariat für Bildung, Forschung und InnovationTakeda CanadaNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchEuropean Academy of Dermatology and VenereologyNHLBI Division of Intramural ResearchPublic Health AgencyNovo NordiskNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesFisher Center for Alzheimer's Research FoundationAgence Nationale de la RechercheEuropean CommissionMerck CanadaMinistère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'InnovationBoettcher FoundationInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicalePfizerModernaFondation du SouffleStavros Niarchos FoundationCSL BehringInstitut des maladies génétiques ImagineAmgenSt. Giles FoundationSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungHoward Hughes Medical InstituteFondation pour la Recherche MédicaleCancer Research InstitutePublic Health Agency of CanadaNational Science Foundation
Mots-clésPandemicDiseasePneumoniaImmunityCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Human geneticsInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Five years ago, we launched the COVID Human Genetic Effort. Our goal was to explain the clinical variability among SARS-CoV-2-exposed individuals by searching for monogenic inborn errors of immunity (IEI) and their phenocopies. We deciphered the pathogenesis of critical COVID-19 pneumonia and multisystemic inflammatory syndrome in children (MIS-C) in ~15% and 2% of cases, respectively, thereby revealing general mechanisms of severe disease. We also defined neuro-COVID-19 genetically and immunologically in one child, while we delineated the immunological mechanisms of COVID-toes in healthy children and young adults, paving the way for their genetic study. Understanding the human genetic and immunological basis of resistance to SARS-CoV-2 infection, long COVID, and myocarditis post mRNA vaccination, has been challenging and investigations remain ongoing. This work highlights the power of patient-based basic research and large-scale international collaborative efforts to discover human genetic and immunological drivers of infectious disease phenotypes, with implications for the timely development of new medical strategies before the next pandemic arrives.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,009
Communication savante0,0050,015
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0050,011
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Human ImmunityMême sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 ResearchTravaux en français237 207