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Enregistrement W4415544009 · doi:10.1016/j.ard.2025.09.015

Autoreactive T cells identified in patients with anti-Jo1+ antisynthetase syndrome recognise a new epitope on histidyl t-RNA synthetase

2025· article· en· W4415544009 sur OpenAlexaff
Angeles S. Galindo‐Feria, Ravi Sharma, Anatoly Dubnovitsky, Christina Gerstner, Genadiy Kozhukh, Annika van Vollenhoven, Juan Sebastian Diaz Boada, Daniel Ramsköld, Adnane Achour, Maryam Dastmalchi, Hugh H. Reid, Tatyana Sandalova, Jamie Rossjohn, Karine Chemin, Vivianne Malmström, Ingrid E. Lundberg, Begum Horuluoglu

Notice bibliographique

RevueAnnals of the Rheumatic Diseases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory Myopathies and Dermatomyositis
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesStiftelsen Professor Nanna Svartz FondAlex och Eva Wallströms Stiftelse för Vetenskaplig Forskning och UtbildningUppsala UniversitetAkademiska SjukhusetScience for Life LaboratoryVetenskapsrådetNational Health and Medical Research CouncilReumatikerförbundetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseUppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational ScienceKonung Gustaf V:s och Drottning Victorias FrimurarestiftelseStiftelsen Konung Gustaf V:s 80-årsfondKarolinska InstitutetMyositis AssociationHjärt-LungfondenÅke Wiberg Stiftelse
Mots-clésEpitopeAntisynthetase syndromeT-cell receptorT cellAntigenT lymphocyte

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives Anti-Jo1+ antisynthetase syndrome (ASyS) is characterised by autoantibodies targeting histidyl t-RNA synthetase (HisRS), association with HLA-DRB1*03:01 and a distinct clinical phenotype including interstitial lung disease, myositis, arthritis, and mechanic's hands. Previous studies of autoreactive HisRS-specific CD4 + T cells point to yet undiscovered T cell epitopes. We aimed to identify new epitopes on HisRS to investigate the presence of autoreactive T cells and their corresponding T-cell receptor (TCR) repertoire from patients with ASyS. Methods Peptides from HisRS N-terminal region with appropriate major histocompatibility complex (MHC) anchor residues were selected for in vitro binding assays. The peptide (HisRS 41-55 ) with the highest HLA-DRB1*03:01 binding affinity was selected for studies with HLA-class II tetramers. Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from patients with ASyS with HLA-DRB1*03:01 (n = 12) were stimulated in vitro with peptide and peptide-HLA-DRB1*03:01 tetramers were used to detect HisRS + CD4 + T cells. Single TCR sequencing of captured T cells allowed analyses of the underlying TCR repertoire. Results We identified a new T cell epitope on HisRS with high affinity for HLA-DRB1*03:01. Autoreactive HisRS + CD4 + T cells were detected in PBMCs of patients (n = 6/12). TCR repertoire analysis of HisRS + CD4 + T cells revealed shared gene V-alpha and beta usages. Moreover, HisRS + CD4 + T cells persisted after treatment in 2 patients (P2 and P4) and 2 identical T cell clones were detected between the initial and follow-up time points in 1 patient (P2). Conclusions Autoreactive T-cells targeting a new HisRS epitope were identified indicating T cell reactivity to diverse epitopes of the HisRS protein in patients with anti-Jo1 autoantibodies. Furthermore, we demonstrated the TCR repertoire of autoreactive HisRS+CD4+T cells in patients. Persistence of these T-cells and specific clones may be contributing to disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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