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Enregistrement W4415552474 · doi:10.1101/2025.10.23.684176

Loss of cell cycle gatekeeping by CNOT3 impairs hematopoietic stem and progenitor cell division and repopulating activity

2025· preprint· W4415552474 sur OpenAlexafffund
Katie A. Yuen, Thilelli Taibi, Marty Yue, Zongmin Liu, Effat Habibi, Elias Spiliotopoulos, Niveditha Ramkumar, Nick Nation, Glenn Edin, Thuy T. M. Ngo, Ly Vu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueHematopoietic Stem Cell Transplantation
Établissements canadiensCanadian Centre for Applied Research in Cancer ControlOccupational Cancer Research CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésHaematopoiesisStem cellProgenitor cellHematopoietic stem cellConditional gene knockoutTranscriptomeGene expression profilingCell cycleBone marrow

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Adult mammalian hematopoietic stem cells (HSCs) constitute a heterogeneous population responsible for generating various cell types in the blood throughout adulthood. Gene expression programs underlying regulation of self-renewal and differentiation of HSCs are tightly regulated. However, how post-transcriptional regulation of gene expression influences HSCs and hematopoiesis remains largely unexplored. Here, we report the critical role of CNOT3, a subunit of the CCR4-NOT complex, in regulating hematopoietic stem cells (HSCs) function in adult hematopoiesis. We observed that Cnot3 mRNA is highly expressed in HSCs and CNOT3 ablation in the murine Cnot3 conditional knockout mouse model resulted in anemia, reduced bone marrow cellularity and enhanced extramedullary hematopoiesis in spleen. Deletion of Cnot3 resulted in the early expansion of immunophenotypic HSCs which were then progressively lost over time. Cnot3 knockout hematopoietic stem/progenitor cells (HSPCs) failed to reconstitute hematopoietic systems of recipient animals in transplantation assays. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis of HSPCs revealed disruptions in lineage development and loss of HSCs. Transcriptomic profiling and cell cycle analysis demonstrated that Cnot3 deletion led to increased cycling activity in HSCs. Our results indicate that CNOT3 is critical for maintenance of homeostasis in HSCs and the hematopoietic system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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