Genome‐Wide Identification of Terpene Synthase ( <scp>TPS</scp> ) Gene Family in <i>Atalantia buxifolia</i> and the Role of <scp>AbTPS08</scp> in Asian Citrus Psyllid Defense
Notice bibliographique
Résumé
Huanglongbing/citrus greening, vectored by the Asian citrus psyllid (ACP), is one of the greatest threats to citrus production worldwide. While certain citrus species and citrus relatives are particularly susceptible to ACP, others are repellent or resistant including the Chinese box orange (Atalantia buxifolia) which is a citrus relative. These resistant species are suspected to contain a diverse suite of terpenoids, plant secondary metabolites that are critical to defense and biosynthesized by terpene synthase (TPS) enzymes. Here, we performed a genome-wide survey of terpene synthase (TPS) genes in A. buxifolia and identified 34 AbTPS genes representing five TPS subfamilies. Analyses of the phylogenetic relationships, intron and exon distributions, and conserved motifs among these and homologous genes suggest that the TPSs are highly conserved across plant species. The distinctive expression patterns of the AbTPS genes among plant tissues highlight their tissue-specific roles in the regulation of terpene biosynthesis. Importantly, AbTPS08 was significantly upregulated by both ACP infestation and methyl jasmonate (MeJA) treatment. Biochemical assays of the recombinant AbTPS08 protein confirmed that AbTPS08 could convert farnesyl pyrophosphate (FPP) to α-farnesene in vitro. Furthermore, Agrobacterium tumefaciens-mediated transient overexpression in citrus callus revealed that AbTPS08 exhibits α-farnesene synthase activity in vivo. AbTPS08 was localized in the cytoplasm, the primary compartment for sesquiterpene synthesis. Overexpression of AbTPS08 in lemon (Citrus limon) was repellent to ACPs in dual-choice feeding assays, increased jasmonic acid (JA) accumulation, and induced the transcription of JA biosynthesis-related genes. This study provides novel insights into sesquiterpene biosynthesis in A. buxifolia and demonstrates that α-farnesene can improve ACP defense directly and indirectly.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».