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Enregistrement W4415586839 · doi:10.1021/acs.jctc.5c01453

ReMLP-NET: A Neural Network Interaction Potential for Molecular Energy Prediction

2025· article· en· W4415586839 sur OpenAlexafffund
Omid Tarkhaneh, Sharene D. Bungay, Robert C. Mawhinney, Raymond A. Poirier

Notice bibliographique

RevueJournal of Chemical Theory and Computation · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueMachine Learning in Materials Science
Établissements canadiensLakehead UniversityMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesMemorial University of Newfoundland
Mots-clésHyperparameterArtificial neural networkEnergy (signal processing)Feature (linguistics)Mean squared errorPerceptronMultilayer perceptronFunction (biology)Pattern recognition (psychology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Deep learning methods have seen increased applications and are now regularly used in chemistry, biology, and related areas. In chemical applications, they are used as an alternative to quantum mechanics (QM) methods to predict molecular energy with a more reasonable computational time. Here, we utilize a machine learning algorithm to predict the molecular total energy of structures containing elements H, C, N, O, F, S, and Cl. Optimized structures and total energies from the Retrievium repository, which includes molecules from the GDB13 and DUD-E sets, were used to train and assess a single Retrievium multilayer perceptron neural network (ReMLP-NET) using an atomic environment vector as the feature set. Symmetry function hyperparameters were selected using a Genetic Algorithm. The proposed method showed improved performance with MAE and root mean squared error values of 1.29 and 1.81 kcal/mol, respectively, compared to 1.53 and 2.16 kcal/mol for ReANI-2x.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,478
Score d'incertitude au seuil0,250

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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