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Enregistrement W4415604679 · doi:10.3389/fimmu.2025.1654617

Case Report: A patient with a novel heterozygous IRF8 variant with repeated infection and immune-mediated organ disease, but without disseminated mycobacterial disease despite BCG immunization

2025· article· en· W4415604679 sur OpenAlexaff
Samuel C. C. Chiang, Erika Owsley, Ammar Husami, Nagako Akeno, Cristina M. Cobb, Yang Li, Rebecca Marsh, Kenneth A. Myers, Tamar Rubin

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensChildren's Hospital of WinnipegChildren's Hospital Research Institute of ManitobaManitoba HealthMcGill UniversityMcGill University Health CentreUniversity of ManitobaMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSecretionVaccinationImmunizationDiseaseImmune systemCytokineStimulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We describe a patient with a novel, de novo heterozygous IRF8 variant (c.1182dup) who presented with viral and bacterial susceptibility, lymphoproliferation, and liver and lung diseases characteristically seen in patients with underlying inborn errors of immunity, but without disseminated mycobacterial disease, despite vaccination with Bacillus Calmette-Guérin (BCG), the live attenuated vaccine form of Mycobacterium bovis . Laboratory evaluation revealed an absence of circulating plasmacytoid dendritic cells (pDC) with poor IL-12p70 and IFN-γ secretion upon LPS stimulation, and poor IFN-γ secretion upon PHA stimulation. In contrast, another patient with a different novel, de novo heterozygous IRF8 variant (c.10C>T) had milder early life infection susceptibility, but no lymphoproliferation, nor immune-mediated organ disease, and no prior exposure to BCG vaccine. They had a normal number of circulating pDC, and IL-12p70 production upon LPS stimulation that was no different compared to the mother who did not possess the IRF8 variant, and with normal IFN-γ secretion upon PHA stimulation. Our findings support impaired IRF8 function in the first patient, but less for the second patient. We propose that altered DC subsets and deficient cytokine production can assist with IRF8 VUS (variant of unknown significance) interrogation. This report expands current knowledge of mono-allelic human IRF8 variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0040,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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