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Enregistrement W4415609892 · doi:10.1039/d5sc04671h

A proto-aldehyde fluorescence quenched substrate for quantitative imaging of both protein and enzyme activity within cells

2025· article· en· W4415609892 sur OpenAlexafffund
Sha Zhu, Matthew C. Deen, Samy Cecioni, K Wong, Evan Perley-Roberston, Weifeng Benny Wu, David J. Vocadlo

Notice bibliographique

RevueChemical Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensBurnaby HospitalSimon Fraser University
Organismes subventionnairesCanadian Glycomics NetworkFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésFluorescenceFluorophoreReductive aminationGreen fluorescent proteinIntracellularBioorthogonal chemistryGlycosidic bondSubstrate (aquarium)HemiacetalEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fluorogenic substrates are emerging tools that enable studying enzymatic processes within their native cellular environments. However, fluorogenic substrates that function within live cells are generally incompatible with cellular fixation, preventing their tandem application with fundamental cell biology methods such as immunocytochemistry. Here we report a simple approach to enable the stable chemical fixation of the fluorescent product of a series of dark-to-light bis-acetal based substrates (BABS). Cleavage of the BABS glycosidic bond leads to liberation of a hemiacetal in which one branch consists of a proto-aldehyde bearing the fluorophore and the other branch consists of an alcohol bearing the quencher. Spontaneous breakdown of this hemiacetal leads to formation of a fluorescent aldehyde. Trapping of this aldehyde by standard reductive amination to intracellular proteins allows its stable retention within cells and concomitant imaging of cellular proteins by traditional immunocytochemistry. These bis-acetal substrates enable measuring changes in lysosomal GCase activity in response to both chemical and genetic perturbations. These tools will aid in studying the role of GCase activity in diseases and accelerate the creation of new therapeutic approaches targeting the GCase pathway. We also expect this strategy to be broadly useful for creating fixable substrates for other lysosomal enzymes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,671

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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