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Enregistrement W4415621337 · doi:10.1038/s41598-025-21433-4

Population genetic structure reveals asymmetric hybridization between Pinus pumila and P. parviflora var. Pentaphylla in the Hakkoda Mountains, Northern Japan

2025· article· en· W4415621337 sur OpenAlexfundno aff
Yumeko Tarusawa, Takuro Ito, Yuji Isagi

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Science and Technology AgencyJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésIntrogressionHybridBackcrossingPollenInterspecific competitionDeciduousHybrid zonePopulationPinus <genus>Adaptation (eye)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interspecific hybridization can facilitate rapid adaptation to novel environments despite potential fitness reductions. The genomic regions of Pinus parviflora var. pentaphylla inhabiting higher temperatures could increase the fitness of the recipient alpine species Pinus pumila, which has adapted to lower temperatures, particularly under global warming. Using exome-capture techniques to overcome challenges of large Pinus genomes, we investigate the genome-wide hybridization patterns between these species in the Hakkoda Mountains, Japan. Hybrids predominantly occurred at mid-elevation and contained P. pumila chloroplasts, suggesting P. pumila is the most recent pollen parent. Genome-wide introgression patterns suggested frequent backcrossing with P. pumila and limited backcrossing with P. parviflora var. pentaphylla, likely owing to geographic isolation, phenological differences in flowering time, and natural selection favoring hybrids in specific environmental contexts. Specifically, tall hybrids may be advantageous in light competition at mid-elevations covered with moorland vegetation, whereas shorter pure P. pumila individuals may be favored in high-altitude wind-exposed fellfields. Hybrids with shorter heights may be disadvantaged in deciduous broad-leaved forests at lower altitudes compared to taller pure P. parviflora var. pentaphylla. Our findings provide insights for future functional analyses of introgressed genes to elucidate the adaptive significance of such hybridization patterns along elevational and environmental gradients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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