YsxC is a placeholder for ribosomal protein uL2 during 50S ribosomal subunit assembly
Notice bibliographique
Résumé
The maturation of the functional core of the 50S ribosomal subunit in Bacillus subtilis is assisted by assembly factors that enhance the efficiency of the process. Two essential assembly factors, the GTPases RbgA and YphC, bind at or near the functional sites of the 50S subunit to promote the folding of ribosomal RNA helices that play key functional roles. YsxC is another GTPase involved in the maturation of the 50S subunit, whose function remains unknown. We demonstrate that YsxC aids 50S assembly through a drastically different mechanism. YsxC binds in the body of the 44.5S large ribosome assembly intermediate, occupying the site where uL2 binds and controls the timing in the folding of rRNA helices forming the binding site for uL2. It creates a "primordial" binding site that includes six out of the eleven rRNA helices forming the uL2 mature binding site. Once YsxC is released, uL2 binds to this "primordial" binding site, and the remaining helices that stabilize uL2 fold, and the entire region adopts the mature conformation. This role of YsxC functioning as a placeholder factor for ribosomal protein uL2 provides the first example of such a factor's involvement in the ribosome assembly process in bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».