Advanced Paternal Age Impacts Common Loci in the Sperm and Placenta DNA Methylomes
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Epidemiological studies have reported an association between advanced paternal age at conception and an increased risk of neurodevelopmental disorders in offspring, such as autism spectrum disorder. Evidence suggests that DNA methylation alterations in spermatozoa of older men may be transmitted to the feto-placental unit and associated with offspring brain development and behavioral differences later in childhood. OBJECTIVE: We aimed to assess the association of advanced paternal age with DNA methylation alterations in the human placenta and compare the results to previous findings in spermatozoa. METHODS: For this study, 64 placenta samples from the Design, Develop, and Discover (3D) prospective birth cohort study were categorized based on paternal age at conception. DNA methylation of the placenta was interrogated using the Illumina 850K array. There were no differentially methylated sites found to be statistically significant after correction for multiple comparisons, therefore sites with significant nominal p values < 0.05 were assessed and used to define differentially methylated regions (DMRs) associated with genes. RESULTS: Advanced paternal age was associated with DNA methylation alterations in the placenta at up to 688 genes, with a predominance of hypomethylation (65%), including at eight imprinted loci. About 7% of genes with age-associated DNA methylation changes in placenta overlapped with genes previously reported to show altered DNA methylation in spermatozoa of older men; seven genes common to placenta and spermatozoa had previously been identified in association with susceptibility to autism spectrum disorder. Among loci most affected, we found evidence of sex-specific hypermethylation at genes linked to neurodevelopment (GRM7, EBF3, FOXG1). CONCLUSION: Our findings suggest that advanced paternal age at conception correlates with altered DNA methylation at a small number of loci in the human placenta, notably affecting genes involved in neurodevelopment. This study highlights the use of the placenta DNA methylome as a surrogate marker for the potential impact of advanced paternal age on the child.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».