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Enregistrement W4415721781 · doi:10.5376/ija.2025.15.0023

Mitochondrial DNA Analysis for Resolving the Phylogenetic Relationships of Tilapia Species

2025· article· W4415721781 sur OpenAlexvenueno aff
Xian Li, Xiaoli Chen, Rudi Mai

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Aquaculture · 2025
Typearticle
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhylogenetic treeTilapiaMitochondrial DNAPhylogeneticsOreochromisGenetic variationAdaptation (eye)DomesticationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oreochromis  spp. (Tilapias) are commercially important fishes with extensive distribution in Africa and other tropical and subtropical regions. Due to morphological similarity, high incidence of hybridization, and complex domestication history, the phylogenetic relationships and taxonomic limits of tilapia species are disputed. In this study, mitochondrial DNA (mtDNA) sequences-COI, CYTB, and D-loop gene fragments-were resolved for some representative Oreochromis  species and geographical populations. Phylogenetic trees were reconstructed using Neighbor-Joining (NJ), Maximum Likelihood (ML), and Bayesian Inference (BI) methods to infer evolutionary relationships. The analyses revealed clear genetic differentiation among tilapia species, while some local strains and hybrid populations contained admixed lineages or overlapping taxonomic signals. Genetic distances among populations generally corresponded to geographic separation, suggesting the combined effects of natural selection and human activity on genetic structure. Functional analysis of the variants of mitochondrial genes identified key loci with a putative association with energy metabolism and reproductive adaptation, suggesting their roles in ecological adaptation and phenotypic evolution. The study explains phylogenetic structure among Oreochromis  species, verifies the feasibility of mtDNA in species identification, germplasm conservation, and molecular breeding, and provides basic data and theoretical basis for further study on tilapia molecular evolution and environmental adaptation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,550
Score d'incertitude au seuil0,593

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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