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Enregistrement W4415727042 · doi:10.1016/j.jmr.2025.107991

Advancing quantitative NMR for high-precision isotopic analysis with rnmrfit 2.0

2025· article· en· W4415727042 sur OpenAlexafffund
Kathy Sharon Isaac, Phuong Mai Le, Theodore Street, Akila Wijerathna-Yapa, Stanislav Sokolenko

Notice bibliographique

RevueJournal of Magnetic Resonance · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueIsotope Analysis in Ecology
Établissements canadiensNational Research Council CanadaDalhousie University
Organismes subventionnairesFaculty of Graduate Studies, Dalhousie UniversityNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRobustness (evolution)Accuracy and precisionAnalytical Chemistry (journal)NMR spectra databaseLine (geometry)SoftwareAnalytical techniqueData processing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quantitative NMR is widely utilized in isotopic ratio measurement for determining the origins and authenticity of chemical compounds. Achieving high precision required for such analyses depends on accurately separating signal from noise, which is essential for reliable quantification of resonance peak areas. In this study, we present rnmrfit 2.0, an NMR peak-fitting tool tailored for high precision isotopic analysis. This new version incorporates semi-global peak fitting with automated peak region selection, achieving greater robustness and computational efficiency than previously reported. The newly developed software was used to explore the impact of two common spectral processing techniques, line broadening and zero filling, as well as the choice of baseline span on peak fitting precision. All three were found to have a significant impact on fit precision, with optimal settings for line broadening and zero filling deviating from what is commonly recommended for 13C spectra, at 1-3 Hz and 0.5-1.0, respectively. Compared to commercial tools including TopSpin and MestReNova, rnmrfit demonstrated superior precision and trueness, achieving precision as low as 0.26% for 2H and 0.16% for 13C. The new version of rnmrfit is available as an open-source executable, offering a scalable solution for isotopic analysis with minimal user input, paving the way for more reliable isotopic quantification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,110

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0330,019

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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