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Enregistrement W4415992375 · doi:10.1111/tra.70022

Beyond the Secretory Pathway: New Insights Into Protein Release

2025· review· en· W4415992375 sur OpenAlexfundno aff
Ruey‐Hwa Chen, Antonio J. Costa‐Filho, Jayanta Debnath, Thierry Galli, Liang Ge, Deborah C. I. Goberdhan, Wei Guo, Kangmin He, Ralf Jacob, Tiebang Kang, Min Goo Lee, Lian Li, Fabio Lolicato, Jun Lu, Vivek Malhotra, Walter Nickel, Vassiliki Nikoletopoulou, Stacey K. Ogden, Georgia Maria Sagia, Feng Shao, Anbing Shi, Clotilde Théry, Christel Vérollet, Julien Villeneuve, Frederik J. Verweij, Yanzhuang Wang, Juan Wang, Shenjie Wu, Yihong Ye, Hang Yin, Li Yu, Min Zhang, Ying Zhang, Xin Zhou, Chiara Zurzolo

Notice bibliographique

RevueTraffic · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueUniversity of Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesNational and Kapodistrian University of AthensInstitute of GeneticsUniversidade de São PauloTsinghua UniversityUniversity of PennsylvaniaBeijing University of TechnologyDirectorate for Biological SciencesNational Institutes of HealthHuazhong University of Science and TechnologyUniversity of OxfordNational Institute on AgingAcademia SinicaShenzhen Bay LaboratorySun Yat-sen UniversitySchool of Medicine, Emory UniversityYonsei UniversityInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicalePhilipps-Universität MarburgHarbin Medical UniversityEmory UniversityUniversité de MontpellierYale University
Mots-clésSecretionEndoplasmic reticulumGolgi apparatusSecretory proteinSecretory pathwayExtracellularCytoplasmSignal peptideTransport protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In eukaryotes, protein secretion plays essential roles in intercellular communications and extracellular niche-building. Protein secretion generally requires a signal sequence that targets cargos to the canonical secretory pathway consisting of the endoplasmic reticulum (ER), the Golgi apparatus, plasma membrane, and vesicles moving between these compartments. However, cytoplasmic proteins lacking signal sequences (e.g., IL1β, Acb1, FGF2) have been detected, and many have defined functions in the extracellular space, suggesting unconventional protein secretion (UcPS) via alternative pathways. In recent years, scientists have uncovered many new UcPS paradigms, reporting a plethora of mechanisms that collectively form a new field. The inaugural Cold Spring Harbor Asia (CSHA) conference on "Molecular Mechanisms and Physiology of Unconventional Secretion" is the first meeting to bring these researchers together, providing a collegial platform for information sharing at this exciting frontier of cell biology research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,005
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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