<i>N</i> -Glycoproteomic Portraits of <i>Bothrops</i> Snake Venoms Reveal Evolutionarily Conserved and Divergent Phenotypes
Notice bibliographique
Résumé
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Glycosylation is a major protein post-translational modification in snake venom proteins and contributes to the diversification of proteomes. In this study, we carried out an in-depth analysis of the glycosylation profile of seven Bothrops venoms, including neutral sugar quantification, glycoprotein profiling by lectin blot, and determination of N -glycosylation sites in proteins and their N -glycan compositions, by direct, intact glycopeptide analysis by mass spectrometry. Interestingly, all identified N -glycosylated peptides were from enzymatic venom components, mainly proteolytic enzymes that are key in envenomation. All venoms revealed a prominent occurrence of fucose and sialic acid in all N -glycosylated toxins identified. The results indicated that in Bothrops venoms, there is an important level of variation in protein primary structure that is not restricted to regions containing N -sequons. Overall, the signatures of N -glycosylated and nonglycosylated peptide backbones and of N -glycan site occupation by different N- glycans revealed conservation of venom phenotype framework and diversification of N -glycan usage. Hence, the molecular mechanisms of toxin structure and function evolution are at the same time dynamic in that they involve a fine-tuning for the presence of distinct glycans as an evolutionary novelty and are subjected to some conservation that results in the clustering of Bothrops venoms according to the species phylogenetic classification.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».