The BCG in situ study – novel techniques applied to a 100-year-old vaccine
Notice bibliographique
Résumé
The use of Bacillus Calmette-Guérin (BCG) vaccine against tuberculosis (TB) spans more than a century. Besides protection against severe paediatric TB, randomized trials and novel advances within innate immunology documented that BCG has beneficial non-specific effects, providing protection against non-TB infections. Since paediatric intradermal BCG vaccination has proved unable to contain adult pulmonary tuberculosis, several novel TB vaccines are under development, most of which build upon BCG. BCG’s status as an essential remedy against TB will therefore be maintained, but despite many decades of near-universal intradermal use, the local responses to BCG in the skin have not been thoroughly elucidated. We therefore developed appropriate methods to capture the localised skin events at the cellular and molecular level after intradermal BCG vaccination. This work informs future studies to identify the immunological events induced following administration of BCG to accelerate development of improved or new vaccines against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) . We employed advanced technologies such as spatial transcriptomics on skin tissue punch biopsies and cell-free plasma transcriptomics (liquid biopsies) to characterize both the local ( in situ ) skin and systemic (peripheral blood) response to BCG via: Whole blood transcriptomics and epigenetic analysis Blood immune cell characterization Plasma proteomic and metabolomic analysis
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».