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Enregistrement W4416021546 · doi:10.1016/j.mex.2025.103712

The BCG in situ study – novel techniques applied to a 100-year-old vaccine

2025· article· en· W4416021546 sur OpenAlexafffund
Frederik Schaltz‐Buchholzer, Ole Bæk, Amrit Singh, Elsi Cá, Isaquel da Silva, Peter Aaby, Christine Stabell Benn, Tobias R. Kollmann, Nelly Amenyogbe

Notice bibliographique

RevueMethodsX · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune responses and vaccinations
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesDalhousie University
Mots-clésVaccinationTuberculosisBCG vaccineImmune systemMycobacterium tuberculosisInnate immune systemIntradermal injectionTuberculosis vaccines

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The use of Bacillus Calmette-Guérin (BCG) vaccine against tuberculosis (TB) spans more than a century. Besides protection against severe paediatric TB, randomized trials and novel advances within innate immunology documented that BCG has beneficial non-specific effects, providing protection against non-TB infections. Since paediatric intradermal BCG vaccination has proved unable to contain adult pulmonary tuberculosis, several novel TB vaccines are under development, most of which build upon BCG. BCG’s status as an essential remedy against TB will therefore be maintained, but despite many decades of near-universal intradermal use, the local responses to BCG in the skin have not been thoroughly elucidated. We therefore developed appropriate methods to capture the localised skin events at the cellular and molecular level after intradermal BCG vaccination. This work informs future studies to identify the immunological events induced following administration of BCG to accelerate development of improved or new vaccines against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) . We employed advanced technologies such as spatial transcriptomics on skin tissue punch biopsies and cell-free plasma transcriptomics (liquid biopsies) to characterize both the local ( in situ ) skin and systemic (peripheral blood) response to BCG via: Whole blood transcriptomics and epigenetic analysis Blood immune cell characterization Plasma proteomic and metabolomic analysis

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,476
Score d'incertitude au seuil0,376

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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