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Enregistrement W4416096008 · doi:10.1080/19490976.2025.2573045

Microbiota shape the colon epithelium controlling inter-crypt absorptive goblet cells via butyrate–GP R109A signalling

2025· article· en· W4416096008 sur OpenAlexaff
Vinícius Dias Nirello, Nathália Araújo, Helder Carvalho de Assis, Mar Moreno‐Gonzalez, Paula Ruiz, Pollyana Ribeiro Castro, Nicolas G. Shealy, Catherine Shelton, Mariane Font Fernandes, Sarah de Oliveira, Mariana Boroni, Bernhard Ryffel, Mariana X. Byndloss, Naiara Beraza, Marco Aurélio Ramirez Vinolo, Patrick Varga‐Weisz

Notice bibliographique

RevueGut Microbes · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensInnovation Cluster (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesUniversidade Estadual de CampinasNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institutes of HealthConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroCentre National de la Recherche ScientifiqueCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorQuadram Institute BioscienceFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésButyrateMicrobiomeEpitheliumPopulationIntestinal epitheliumShort-chain fatty acidGut floraReceptorFunction (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The colonic epithelium is a key interface between the gut microbiota and the host. How microbiota-derived signals influence epithelial cell identity and function remains incompletely understood. Here, we used single-cell transcriptomics, antibiotic-mediated microbiota depletion, germ-free mice and colonization experiments in mice to uncover cell-type-specific responses to microbiota changes, highlighting changes in the cell composition and functional diversities in enterocytes. Our analysis demonstrates that the microbiota control the absorptive profile of the colon epithelial cells and reveals non-canonical inter-crypt goblet cells as microbiota-responsive constituents that combine absorptive and secretory features and whose abundance is regulated by the gut microbiota. We found that their number is suppressed through the short-chain fatty acid butyrate and its receptor GPR109A. Analysis in mouse and humans indicates that the expansion of this hybrid population increases with age and that this expansion is driven by microbiome changes. Our work reveals a previously unrecognized level of epithelial plasticity driven by microbial triggers and highlights butyrate, acting as a signaling molecule that shapes the colon micro-anatomy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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