Comparative ASCL1 Interactome Analysis Reveals CDK2–Cyclin A2 as Suppressors of Differentiation in <i>MYCN</i> -Amplified Neuroblastoma
Notice bibliographique
Résumé
Neuroblastoma is a heterogeneous pediatric cancer arising from developmentally arrested neuronal precursors, in which restoring differentiation offers therapeutic promise. Achaete-scute homolog 1 (ASCL1), a proneural transcription factor, is widely expressed in neuroblastoma and can drive either proliferation or differentiation depending on the cellular context. In this study, we show that distinct MYCN-amplified neuroblastoma cell lines exhibit differing differentiation responses to ASCL1 overexpression. By comparing genome-wide ASCL1 chromatin binding, transcriptional changes, and protein-protein interactions, we found that ASCL1 binds more extensively to neuronal proteins in a cell line that is more susceptible to ASCL1-driven differentiation but associates with cell-cycle regulators in less responsive cells. We show that cyclin-dependent kinase 2 (CDK2)-cyclin A2 bind ASCL1 in less responsive cells, with CDK-mediated phosphorylation of ASCL1 limiting the ability of ASCL1 to drive differentiation. IMPLICATIONS: Our study reveals that context-dependent interactions of ASCL1 with protein partners on the chromatin control its ability to reengage a differentiation program in neuroblastoma.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».