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Enregistrement W4416344598 · doi:10.1186/s13007-025-01471-9

PVP-40 mediated enhancement of mesophyll protoplast yield and viability for transient gene expression in black huckleberry

2025· article· en· W4416344598 sur OpenAlexafffund
Sweety Majumder, Abir U. Igamberdiev, Samir C. Debnath

Notice bibliographique

RevuePlant Methods · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant tissue culture and regeneration
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésProtoplastGene expressionYield (engineering)GenePhenotypeIsolation (microbiology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Black huckleberry ( Vaccinium membranaceum ) is a native fruit species of high nutritional, medicinal, ecological, and economic value. The black huckleberries, abundant in bioactive compounds, offer significant antioxidants and anti-inflammatory effects and play a key role in maintaining wildlife and forest ecosystems. Despite its importance, protoplast isolation and gene editing have not been reported in this species. These techniques are essential for functional genomics and crop improvement, but the recalcitrant nature of this species, complex genome, and variable ploidy present significant challenges for cellular and molecular manipulation. This study aimed to establish a reliable protocol for efficient mesophyll protoplast isolation and transient gene expression in V. membranaceum using in vitro-grown leaves. Results A systematic optimization of enzyme composition, osmotic concentration, antioxidant supplementation, and pH was undertaken to enhance protoplast yield and viability in V. membranaceum . The optimized enzymatic combination of 2% cellulase R-10, 1% hemicellulase, 1% Macerozyme R-10, and 1.5% pectinase facilitated efficient cell wall degradation while maintaining structural integrity. The inclusion of 0.6 M mannitol ensured osmotic stability, and 1% PVP-40 effectively suppressed phenolic oxidation, significantly improving protoplast viability. A near-neutral pH of 5.8 supported optimal enzyme activity without inducing cellular damage. Under these optimized conditions, 14 h enzymatic digestion produced 7.20 × 10⁶ protoplasts g⁻ 1 FW with 95.1% viability. Subsequent optimization of PEG-mediated transformation identified 40% PEG-4000 with 30 µg plasmid DNA as the most effective combination, achieving 75.1% transient expression efficiency. Nuclear localization of GFP-tagged proteins, confirmed by DAPI staining, validated the robustness of the optimized system. Conclusions This study presents a standardized, PVP-40–enhanced protocol for mesophyll protoplast isolation with notable yield and viability in V. membranaceum , supporting efficient transient gene expression. The method provides a robust platform for functional genomics, gene editing, and biotechnological applications in this underutilized species and other related plant species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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