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Enregistrement W4416356080 · doi:10.1021/acssensors.5c01191

Novel Near-Infrared Fluorescent Protein for Biliverdin Biosensing with a Hydrogel Scaffold

2025· article· en· W4416356080 sur OpenAlexaff
Y Zhao, Benjamin Kim, Victor Mun-Sing Sit, Lidija Malic, Teodor Veres, Michael Z. Lin

Notice bibliographique

RevueACS Sensors · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Health and Biochemistry
Établissements canadiensMedical Council of CanadaNational Research Council CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Science Foundation Graduate Research Fellowship ProgramSchool of Medicine, Stanford UniversityNational Institutes of Health
Mots-clésBiliverdinFluorescenceFluorescent proteinGreen fluorescent proteinEnzymeBiosensorBiliverdin reductaseProtein engineeringProtein design

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the first infrared fluorescent protein engineered from a bilin reductase scaffold. Unlike existing near-infrared fluorescent proteins, which are derived from photoreceptor domains, our design is based on phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase (PcyA), an enzyme that normally catalyzes the reduction of biliverdin (BV) to phycocyanobilin. By disabling its catalytic activity and remodeling its chromophore-binding pocket, we repurposed PcyA to stably accommodate BV as a fluorescent chromophore, generating a BV reporter with infrared output (BRIO). Finally, we demonstrated that hydrogel-encapsulated BRIO-expressing cells can serve as an inexpensive and robust platform for BV detection in biological samples. This work expands the landscape of fluorescent protein design beyond photoreceptors, demonstrating that metabolic enzymes can be reprogrammed into bright fluorescent reporters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,539

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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