Genetic signatures of responsiveness in idiopathic normal pressure Hydrocephalus: Insights from whole-exome and LASSO-based analysis
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Background: Idiopathic normal pressure hydrocephalus (iNPH) is a potentially reversible neurological disorder characterised by the triad of gait disturbance, cognitive decline, and urinary incontinence, together with ventriculomegaly despite normal cerebrospinal fluid (CSF) pressure (1-3). Although traditionally considered non-genetic and multifactorial, emerging data suggest that rare pathogenic variants and cilia-related mechanisms may contribute to its pathogenesis and modulate responsiveness to CSF diversion (8-12). Methods: We performed whole-exome sequencing (WES) in 33 consecutive patients with clinically and radiologically confirmed iNPH who underwent a standardised 120-h lumbar drainage (LD) protocol. Responders were defined as those showing ≥20 % improvement in gait speed or ≥3-point increase in Montreal Cognitive Assessment (MoCA) score compared with baseline. Variants were filtered according to ACMG/AMP guidelines (19) and population allele frequency (minor allele frequency <1 %). Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO) logistic regression (20) with ten-fold cross-validation was applied to identify gene-level predictors of LD responsiveness. Results: After filtering, 110 genes with at least one pathogenic or likely pathogenic variant were retained for modelling. LASSO regression at the λ.1se threshold identified a five-gene panel-FANCD2, ATR, ORAI1, MUC1, and RP1L1-involved in DNA damage response, calcium signalling, epithelial barrier integrity, and ciliary architecture (21-28). The internally derived model achieved an accuracy of 81.8 %, sensitivity 68.8 %, specificity 94.1 %, and positive predictive value 91.7 % for prediction of LD response. Conclusions: Rare pathogenic variants in genes linked to genome stability, immune and calcium signalling, and ciliary structure may influence LD responsiveness in iNPH. The five-gene model represents a biologically plausible, hypothesis-generating tool for preoperative risk stratification. Validation in larger, multicentre cohorts, integration with shunt outcomes, and functional studies are required before any clinical implementation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle