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Enregistrement W4416438692 · doi:10.1139/gen-2025-0066

Revealing degradation strategy of aniline blue by <i>Lysinibacillus</i> sp. 38-6 via genomic analysis

2025· article· en· W4416438692 sur OpenAlexvenueno aff
Dai Di Chen, Xiao Liu, Liu Lian Zhang, Jiu Hua Zhang, Wen Ting Ban, Qing‐Bin Lu, Q Li, Jin Chuan Wu

Notice bibliographique

RevueGenome · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEnzyme-mediated dye degradation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBasic and Applied Basic Research Foundation of Guangdong Province
Mots-clésAnilineDegradation (telecommunications)GeneStrain (injury)BacteriaGenomeBiodegradationgenomic DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aniline blue, a triphenylmethane dye, has been widely used in industrial and medical fields, leading to its gradual enrichment in environmental water. Its removal and degradation from the water is essential but very challenging. A bacterium Lysinibacillus sp. 38-6, which is able to efficiently degrade aniline blue, was isolated from the surface soil samples under withered leaves. The strain exhibited excellent decolorization capacity at high concentrations of aniline blue (91% at 1000 mg/L) and salt (90% at 75 g/L) as well as high temperature (92% at 45 °C). To investigate the dye degradation strategies of Lysinibacillus sp. 38-6 at the genomic level, its genome was sequenced and analyzed. The isolate possesses abundant genomic features responsible for degrading dyes. In particular, several genes encoding laccase, iron-dependent peroxidase, NAD(P)H-dependent FMN reductase, and short-chain dehydrogenase/reductases might contribute to the cleavage of chromophore groups and aromatic rings in aniline blue. In addition, a number of genes required for heat, salt, and oxidative stress responses were found, indicating that Lysinibacillus sp. 38-6 is able to efficiently degrade dyes at higher temperature, salty and oxidative environments. It is thus inferred that isolate 38-6 has the potential for applications in efficient degradation of aniline blue in wastewater treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,811
Score d'incertitude au seuil0,330

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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