Structural Variation of Chicken Genome: Genetic Basis in Domestication and Evolution
Notice bibliographique
Résumé
The domestic chicken (Gallus gallus domesticus) is one of the most common domestic animals around us. It is widely distributed around the world, closely related to human life, and is an animal with high economic value. In recent years, with the development of high-throughput sequencing technology, scientists have found that the impact of "structural changes" in the genome (such as large changes such as duplication and deletion of gene segments) on the domestication and trait evolution of chickens may be more important than we thought. Starting from the structure of the chicken genome, this article explains the types of variation, detection technology, and its important role in evolution and artificial selection. The article focuses on the origin mechanism of SV, the distribution differences among different chicken species, and its impact on gene expression, phenotype, and domestication traits (such as feather color, comb shape, growth rate, and egg-laying ability). Finally, a specific case, the duplication variation of the TBC1D1 gene region in broilers, is used to explore the mechanism of SV in the rapid growth trait of broilers. At the end of the article, we look forward to the application prospects of emerging technologies such as single-cell analysis, pan-genome construction, and genomic selection in SV research and poultry breeding. Structural variation is an important genetic basis in the process of domesticated chickens. In-depth research on the mechanisms and functions contained therein will help reveal the genetic nature of complex traits and promote the development of precision breeding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».