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Enregistrement W4416448186 · doi:10.1016/j.idcr.2025.e02434

First case of bloodstream infection caused by Cupriavidus metallidurans in Japan

2025· article· en· W4416448186 sur OpenAlexaboutno aff
Kozi Hosoya, Satomi Takei, Naoya Ogura, Ayako Nakamura, Hidenori Yoshii, Tomomi Matsubara, Tadashi Miyazaki

Notice bibliographique

RevueIDCases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInfections and bacterial resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clés16S ribosomal RNABloodstream infectionGram stainingAntibioticsBacteremiaPhylogenetic treeBlood cultureRibosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the first case in Japan of a bloodstream infection caused by Cupriavidus metallidurans . The patient was a 77 years old man hospitalized for treatment of heart failure and diabetes. On day 83 of hospitalization, he developed a fever of 38.0°C, followed three days later by an elevation in C-reactive protein. His condition improved with the administration of cefmetazole, cefepime, and levofloxacin, and antibiotic therapy was discontinued on day 17. Blood cultures collected at the onset of fever revealed growth in the aerobic bottle after 21 h, and Gram staining revealed slightly slender Gram-negative rods. Based on colony morphology, Burkholderia or Ralstonia was initially suspected. However, identification kit ID Test NF-18 yielded multiple possible organisms, and a definitive identification could not be made. The isolate was ultimately identified as C. metallidurans by phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene. Because this species is not included in general bacterial identification kits and cannot be reliably distinguished based biochemical characteristics alone, 16S rRNA gene sequencing was essential for diagnosis. To date, only five cases of bloodstream infection caused by this species have been reported, in Canada and Italy, and this is the first reported case in Japan. As this bacterium is present in the Japanese environment, reports of its detection may increase in the future, particularly among elderly or immunocompromised patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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