The trimeric Shu complex in <i>C. elegans</i> is an ATPase that remodels RAD51 filaments in the homologous recombination-associated DNA damage response
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Homologous recombination (HR) is critical to error-free lesion bypass in the DNA damage response. This error-free lesion tolerance pathway is initiated by the RAD51 recombinase, which forms nucleoprotein filaments on single-stranded DNA (ssDNA) to facilitate template-directed repair using homologous sister chromatids. RAD51 filaments are tightly regulated by RAD51 mediator proteins. Among these, the Shu complexes facilitate HR-directed DNA damage tolerance and are evolutionarily conserved from yeast to humans. The Caenorhabditis elegans Shu complex is a heterotrimer consisting of three protein subunits: RFS1, RIP1, and SWS1. However, the biochemical properties of this trimeric complex remain unclear. Here, we report the biochemical characterization of the C . elegans Shu complex and interactions with DNA, ATP, and Rad51 filaments. We first revealed that the Shu trimer preferentially binds DNA with an exposed 5′ end, particularly favoring a fork-shaped double-stranded DNA (dsDNA). Then, we found that the trimer binds to ATP and exhibits DNA-dependent ATPase activity. Through site-specific mutagenesis, we identified the catalytic residues in the RFS1 domain and validated the ATPase activity. Using fluorescence-based assays, we further demonstrated that the Shu trimer remodels RAD51 filaments in an ATP-hydrolysis-dependent manner and stabilizes the filaments in an ATP-binding-dependent manner. These findings provide key mechanistic insights into how the C . elegans Shu complex regulates RAD51 filaments, priming them for downstream HR-mediated DNA repair processes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».