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Enregistrement W4416605827 · doi:10.1016/j.cell.2025.11.025

Structural and functional characterizations of infectivity and immune evasion of SARS-CoV-2 Omicron

2025· article· en· W4416605827 sur OpenAlexfundno aff
Zhen Cui, Pan Liu, Nan Wang, Lei Wang, Kaiyue Fan, Qianhui Zhu, Kang Wang, Ruihong Chen, Rui Feng, Zijing Jia, Minnan Yang, Ge Xu, Boling Zhu, Wangjun Fu, Tianming Chu, Leilei Feng, Yide Wang, Xinran Pei, Peng Yang, X. Sunney Xie, Yunlong Cao, Xiangxi Wang

Notice bibliographique

RevueCell · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesZhejiang Provincial Ten Thousand Plan for Young Top TalentsNational Key Research and Development Program of ChinaCanadian Anesthesiologists' SocietyBeijing Municipal Science and Technology CommissionChinese Academy of Medical SciencesMinistry of Science and Technology of the People's Republic of China
Mots-clésEvasion (ethics)InfectivityImmune systemAntigenImmunity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the originally published version of this paper, the authors noted errors in several parts of the manuscript.In Figure 5C, a typographical error appeared in the table: ''Omicron+R346R'' should read ''Omicron+R346K.''In the STAR Methods section, within the ''Recombinant DNA'' section of the key resources table (the third row, the first column), the mutation ''Q493K'' should be corrected to ''Q493R.''The same correction applies to the second line on page e3 of the PDF, where ''Q493K'' should also be ''Q493R.'' In Figure 3F, during image analysis, the same raw negative-stain EM image was accidentally reused in different panels due to a filesaving oversight.Because of the large size of the images, the authors zoomed in to highlight representative parts of the images for detailed observation.The image-saving software automatically stored new files in the last-used directory when they forgot to manually change the path of the folder, which led to duplicate files saved in two folders.This resulted in the raw images for ''Omicron-ACE2 & Trypsin'' and ''Delta-apo'' mistakenly being used for preparing the panels of ''WT-ACE2 & Trypsin'' and ''WT-apo,'' respectively, When zooming in on different regions, the raw image for ''Omicron-ACE2 & Trypsin'' was used both for the ''Omicron-ACE2 & Trypsin'' panel and mistakenly for the ''WT-ACE2 & Trypsin'' panel, causing partial overlap in the published figure.Similarly, the raw image for ''Delta-apo'' was used both for the ''Delta-apo'' panel and mistakenly for the ''WT-apo'' panel, leading to partial overlap.The authors apologize for any confusion these errors may have caused.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,284
Score d'incertitude au seuil0,228

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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