Parallel Genome‐Wide CRISPR Screens Reveal SORL1 and ZFYVE19 as Sequential Host Determinants of <i>Salmonella</i> Infection
Notice bibliographique
Résumé
Salmonella enterica, a major cause of gastroenteritis and typhoid fever, hijacks host machinery to invade cells, and replicate within a specialized niche. While some host factors are known, a comprehensive, temporally-resolved understanding of the host-pathogen interface has been hindered by a lack of suitable genome-wide methodologies. To address this, a parallel CRISPR screening platform is developed to identify host determinants for distinct infection stages. An invasion screen captured factors for bacterial entry, while a fitness screen identified factors governing long-term survival. The screens reveal a temporal switch in host dependency, from endosomal trafficking in early infection to cell cycle and DNA damage response pathways governing host cell fitness in long-term infection. Notably, the approach uncovers two novel host factors with stage-specific roles, SORL1 as a mediator of bacterial invasion and ZFYVE19 as a factor supporting intracellular proliferation. Genetic disruption of SORL1 or ZFYVE19 validate these roles, leading to impaired invasion or replication, respectively. Importantly, antibody-mediated blockade of SORL1 effectively prevented Salmonella entry, highlighting it as a novel host-directed therapeutic target. Together, the screening strategy provides a powerful framework for the temporal dissection of host-pathogen interactions, revealing novel biology and promising therapeutic targets.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».