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Enregistrement W4416610070 · doi:10.5256/f1000research.155278.r202703

Referee report. For: Identification of high-performing antibodies for Superoxide dismutase [Cu-Zn] 1 (SOD1) for use in Western blot, immunoprecipitation, and immunofluorescence [version 2; peer review: 1 approved]

2023· article· en· W4416610070 sur OpenAlexfundno aff
Nishant N. Vaikath

Notice bibliographique

RevueFaculty of 1000 Research Ltd · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMetal-Catalyzed Oxygenation Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGenentechGovernment of CanadaOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaAMitacsOntario GenomicsGenome CanadaBayerMotor Neurone Disease AssociationPfizerBristol-Myers Squibb
Mots-clésImmunofluorescenceSuperoxide dismutaseAntibodyIdentification (biology)Indirect immunofluorescence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Superoxide dismutase [Cu-Zn] 1 (SOD1), is an antioxidant enzyme encoded by the gene SOD1 , responsible for regulating oxidative stress levels by sequestering free radicals. Identified as the first gene with mutations in Amyotrophic lateral sclerosis (ALS), SOD1 is a determinant for studying diseases of aging and neurodegeneration. With guidance on well-characterized anti-SOD1 antibodies, the reproducibility of SOD1 research would be enhanced. In this study, we characterized eleven SOD1 commercial antibodies for Western blot, immunoprecipitation, and immunofluorescence using a standardized experimental protocol based on comparing read-outs in knockout cell lines and isogenic parental controls. We identified many high-performing antibodies and encourage readers to use this report as a guide to select the most appropriate antibody for their specific needs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,600
Score d'incertitude au seuil0,571

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,6000,330

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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