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Enregistrement W4416663066 · doi:10.1080/13816810.2025.2591819

Identification of novel pathogenic variants in the <i>PHYH</i> gene and extending the phenotypic range in Refsum disease

2025· article· en· W4416663066 sur OpenAlexafffund
Cheryl Y. Gregory‐Evans, Anna Lehman, André Mattman, Kevin Gregory-Evans

Notice bibliographique

RevueOphthalmic Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFoundation Fighting Blindness
Mots-clésRetinal degenerationIdentification (biology)GeneMacular degenerationPhenotypeMacular dystrophyRetinitis pigmentosaDiseaseRetinal

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose Two patients with a suspected inherited retinal dystrophy (IRD) were referred to a specialist ophthalmology clinic for genetic testing to determine the cause of their disease.Case Report A 50-year-old female patient (P1) presented with retinitis pigmentosa and poor vision since childhood. Molecular genetic testing in P1 revealed two novel pathogenic variants in PHYH (NM_006214.4): p.(Val93*) and p.(Asn71Ilefs*23). A 57-year-old male patient (P2) presented with pigmentary changes at the macula. Molecular genetic testing in P2 revealed two novel variants in PHYN: p.(Phe183Ser) and c.2461G>C (splice acceptor). Both patients were referred to the metabolic disease clinic and phytanic acid levels were found to be 256 µg/mL in P1 (normal is < 3 µg/mL) and 48.2 µmol/L in P2 (normal is < 2.2 µmol/L) confirming the diagnosis of Refsum disease. Both patients shared systemic features of the disease including bilaterally abnormal metatarsals and dry skin, while P1 also had characteristic anosmia, kidney disease, peripheral neuropathy and mild hearing impairment.Conclusion We document for the first time an association between macular dystrophy and Refsum disease. Early diagnosis is important so that diet can be modified to improve prognosis for the complications associated with Refsum disease, although improvements in vision, slowing the retinal degeneration and overcoming refractory miosis, are less achievable.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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