Biodegradable plastic exposure enhances microbial functional diversity while reducing taxonomic diversity across multi-kingdom soil microbiota in cherry tomato fields
Notice bibliographique
Résumé
Plastic films are extensively utilized in agroecosystems, and their residues are accumulating in global soil at a worrying rate. Biodegradable films are employed as a substitute for polyethylene (PE) films due to their rapid degradation rate. Although the taxonomic diversity of soil microbiome in response to biodegradable films has been studied, its alterations in functional diversity remain unexplored. Here, we conduct a two-year field experiment in cherry tomato to address how PE and poly (butylene adipate-co-terephthalate) (PBAT) influences soil microbiota across multi-kingdom (bacteria, fungi, and protists) regarding its taxonomic and functional diversity. The results show that PBAT exposure reduces the taxonomic diversity while increasing functional diversity across multi-kingdom domains compared to PE exposure. We further find that the decreased taxonomic diversity under PBAT exposure reduces the complexity of microbial inter-kingdom and internal-kingdom networks. Conversely, PBAT exposure enhances microbial functional diversity (Shannon index) and average genome size, accompanied by elevated abundances of plastic-degrading genes as well as carbon, nitrogen, phosphorus, and sulphur cycling functional genes. Overall, our study indicates that environmental filtration induced by PBAT exposure changes the microbial life adaptive strategies and leads to a decoupling between taxonomic diversity and functional diversity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».