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Enregistrement W4416674041 · doi:10.1186/s12870-025-07757-3

Genome-wide analysis of soybean MLPs reveals evolutionary and structural insights into drought, salt stress and ABA responses

2025· article· en· W4416674041 sur OpenAlexaff
Xiaocen Ma, Qing Yu, Qi Wang, Yixuan Li, Heng Liu, Siyu Chen, Wei Wang

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Shandong Province
Mots-clésAbscisic acidGeneAbiotic stressPhylogenetic treeGene familyGene expression profilingStructural similarityPhylogeneticsGene cluster

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The major latex protein (MLP) gene family, which is part of the Bet v 1 superfamily, is known for its roles in plant development and stress responses. However, the MLP gene family in soybean (Glycine max) remains insufficiently characterized. In this study, we systematically identified 17 MLP genes (GmMLPs) containing the conserved Bet v 1 domain within the soybean genome. These genes were classified into three subgroups—Type I, Type II, and Type III—based on sequence similarity and phylogenetic analysis. Chromosomal mapping revealed an uneven distribution of GmMLPs across the 20 soybean chromosomes, with a tendency to cluster in the lower arm regions, indicating nonrandom chromosomal localization. Gene structure analysis revealed that most GmMLPs contain a single intron, whereas a few, such as GmMLP3 and GmMLP4, possess multiple introns, reflecting structural diversity within the gene family. Expression profiling using qRT‒PCR demonstrated that several GmMLPs are responsive to abscisic acid (ABA), drought, and salt stress, suggesting potential roles in abiotic stress responses. These findings provide a comprehensive foundation for future functional studies of the role of GmMLPs in stress tolerance and adaptation in soybean.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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