Results from the Survey of Antibiotic Resistance (SOAR) 2020–21 in Vietnam: data based on CLSI, EUCAST (dose-specific) and pharmacokinetic/pharmacodynamic (PK/PD) breakpoints
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Antibiotic susceptibility determination of Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae from community-acquired respiratory infections collected in 2020-21 from two hospitals in Ho Chi Minh City, Vietnam. METHODS: MICs were determined by CLSI broth microdilution; susceptibility was interpreted based on CLSI, EUCAST and pharmacokinetic/pharmacodynamic (PK/PD) breakpoints. RESULTS: A total of 144 S. pneumoniae and 191 H. influenzae isolates were collected. S. pneumoniae susceptibility to amoxicillin and amoxicillin/clavulanic acid (2:1) was 56.9% and 56.3% (CLSI), 29.2% and 25.7% (EUCAST high-dose) and 78.5% using high-dose amoxicillin (4 g/0.25 g/day, PK/PD). Susceptibility to ceftriaxone was 91.7% by EUCAST (high-dose) and 50.7% by CLSI or PK/PD. Pneumococcal cefotaxime susceptibility was 61.8% by CLSI (29.9%, EUCAST). Penicillin susceptibility was 69.4% by CLSI intravenous/EUCAST high-dose, but 6.3% using CLSI oral/EUCAST low-dose breakpoints. Tetracyclines, macrolides and trimethoprim/sulfamethoxazole had 5.6%-16.7% susceptibility.Among H. influenzae isolates, 59.7% were β-lactamase-negative, of which 87.7% and 74.6% were ampicillin-resistant (BLNAR) following EUCAST and CLSI criteria, respectively. H. influenzae fluoroquinolone, macrolide and tetracycline susceptibility reached 62.0%-89.5% (CLSI, EUCAST); macrolide susceptibility was 3.7%-5.8% (PK/PD). All were susceptible to ceftriaxone (all breakpoints) and cefotaxime (CLSI, PK/PD); cefotaxime susceptibility was 15.7% by EUCAST. H. influenzae amoxicillin/clavulanic acid susceptibility was 45.5% (EUCAST) and 32.5% (CLSI) but increased to 82.8% with high-dose (4 g/0.25 g/day, PK/PD). CONCLUSIONS: The hospitals showed high rates of penicillin-resistant S. pneumoniae and BLNAR H. influenzae. S. pneumoniae showed low susceptibility to macrolides and several cephalosporins. H. influenzae fluoroquinolone susceptibility was 88.0%-89.0% (CLSI). Future surveillance across Vietnam will help understand susceptibility trends over time and regions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».