Structural determinants of SlpA-mediated phage recognition in Clostridioides difficile
Notice bibliographique
Résumé
Phage therapy is a promising alternative to antibiotics for treating Clostridioides difficile infections. Despite its fundamental importance, the initial and most critical step of C. difficile phage infection cycle - the precise recognition of a host receptor - remains poorly understood. The surface-layer protein SlpA was previously identified as a general phage receptor in C. difficile, but the molecular determinants of phage-S-layer interactions remain unclear. We investigated the structural features of SlpA required for phage recognition by engineering and expressing modified isoforms in FM2.5 and R20291 ΔslpA strains. By deleting specific SlpA domains and creating chimeric constructs from different isoforms, we assessed the capacity of seven phages to adsorb and infect the complemented strains. Our results demonstrate that both the LMW and HMW fragments of the S-layer protein contribute to phage specificity in an isoform-dependent manner. In addition, the LMW D2 domain is frequently required, but not always essential for productive infection. Several phages were also able to infect some of the complemented strains despite poor or delayed adsorption, highlighting differences in receptor binding. Interestingly, some phages adsorbed efficiently but failed to infect, showing that the capacity to bind to a host is not always predictive of a successful infection. Our findings reveal the complexity of phage-host interactions in C. difficile and provide new insights into the structural features of the S-layer protein that govern phage binding. These findings will be instrumental in guiding the future design of phage cocktails to target a broad spectrum of C. difficile clinical isolates.
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Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».