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Enregistrement W4416738208 · doi:10.1016/j.immuni.2025.10.014

Topography of the HLA-A protein enforces shared and convergent immunodominant B cell and antibody alloresponses in transplant recipients

2025· article· en· W4416738208 sur OpenAlexaff
John T. Killian, R. Glenn King, Aaron Lucander, James L. Kizziah, Christopher Fucile, Rubén Díaz-Avalos, Shihong Qiu, Aarón Silva-Sánchez, Betty Mousseau, Kevin Macon, A. Callahan, Guang Yang, Md Emon Hossain, Jobaida Akther, Susan Kelso, Julie A. Houp, Frida Rosenblum, Paige M. Porrett, Song Ong, Vineeta Kumar, Erica Ollmann Saphire, John F. Kearney, Troy D. Randall, Alexander F. Rosenberg, Todd J. Green, Frances E. Lund

Notice bibliographique

RevueImmunity · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensEmmanuel Bible College
Organismes subventionnairesArgonne National LaboratoryNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute on Drug AbuseNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNIH Office of the DirectorNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthUniversitat Autònoma de BarcelonaGeorgia Research Alliance
Mots-clésAntibodyB cellEpitopeImmunodominanceHLA-BAntigenHuman leukocyte antigenT cellCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Donor-specific antibody responses against human leukocyte antigen (HLA) proteins mismatched between transplant donors and recipients cause allograft loss, yet the structural HLA epitopes targeted by alloreactive B cells and antibodies remain largely unresolved. We profiled the HLA-A ∗ 01:01-specific B cell response in the transplanted kidney and blood of a recipient undergoing antibody-mediated rejection and identified immunodominant B cell and antibody responses that emerged early in the alloimmune response. These responses were focused on topographically exposed mismatched HLA residues located in the α helices along the peptide-binding groove of HLA-A ∗ 01:01. We demonstrated that the anti-HLA-A ∗ 01:01 B cell alloresponse converged and was maintained on this same immunodominant HLA subregion, which comprises only 20% of the HLA molecule, in a diverse group of HLA-A ∗ 01:01-mismatched transplant recipients. Thus, the B cell and antibody alloresponses appear tightly focused on a topographically defined region on the HLA-A ∗ 01:01 crown that is conserved across individuals expressing distinct constellations of self-HLA-A.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,224
Score d'incertitude au seuil0,591

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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