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Enregistrement W4416807566 · doi:10.1016/j.ebiom.2025.106036

Early lymph node T follicular helper cell signalling hub drives influenza vaccine response in an ancestrally diverse cohort

2025· article· en· W4416807566 sur OpenAlexaff
Jacqueline H. Y. Siu, Sofia Coelho, Aime Palomeras, Sandra Belij‐Rammerstorfer, Chloe H. Lee, Tamara Ströbel, Christopher J. Thorpe, Charandeep Kaur, Tom Cole, Nico Remmert, Jamie Fowler, Sam Pledger, Kyla Dooley, Terrence Chan, Katja Höschler, Maria Zambon, Daniel Opoka, Tamás Szommer, Seung J. Kim, Vinod Kumar, Samantha Vanderslott, Pontiano Kaleebu, Donald B. Palmer, Teresa Lambe, Brian D. Marsden, Hashem Koohy, Mark Coles, Calliope A. Dendrou, Katrina M. Pollock

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsWellcome TrustNIHR Oxford Biomedical Research CentreNIHR Imperial Biomedical Research CentreChan Zuckerberg InitiativeMedical Research CouncilJanssen BiotechRoyal SocietyNational Institute for Health and Care ResearchHorizon 2020 Framework ProgrammeUK Research and InnovationSilicon Valley Community Foundation
Mots-clésCohortVaccinationCohort studyInfluenza vaccineFollicular phaseLymph nodeImmune systemB cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Early in vivo dynamics of human immune-cell activation across regionally activated lymphoid tissue sites upon immunisation are poorly characterised in ancestrally-diverse individuals with consequences for pandemic preparedness. Methods In this experimental medicine study, draining and non-draining lymph nodes (dLNs and ndLNs) were studied by ultrasound (US)-guided fine-needle aspiration (FNA) in 13 adults aged 18–55 years with African and Asian ancestry, before and after receiving adjuvanted seasonal influenza vaccine (aQIV). A multi-modal investigation of ultrasound data, genotyping, systems serology, and single-cell multi-omics was undertaken. Findings HLA subtypes reflected self-declared ethnicity and included understudied alleles. Draining but not ndLNs rapidly increased in size post-vaccination, by day 3, with distinct cellular dynamics culminating in a cross-protective serological response. Dissecting LN cellular diversity into 42 lymphoid and non-lymphoid cell states, early post-vaccination cell abundance changes were observed across all LNs, but dLNs were characterised by CD4 + T follicular helper (CD4 + Tfh) cell expansion. Gene expression analysis revealed a dLN post-vaccination hub defined by CD4 + Tfh signalling, cross-compartmental activation, translation, and enhanced antigen-presentation capacity. Interpretation Early CD4 + Tfh coordination in draining lymphoid tissue underpins robust responses to adjuvanted influenza vaccine that transcend ancestral inter-individual variation in young adults, with implications for vaccine design in ancestrally-diverse populations. Funding The study was funded by the Silicon Valley Community Foundation with a Chan Zuckerberg Initiative donation. The funder had no role in the study design, data analysis or decision to publish. The funder provided infrastructure support for the posting of the dataset with CELLxGENE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,203
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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