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Enregistrement W4416834937 · doi:10.18331/brj2025.12.4.5

Cell factories and transcription factor engineering for bioproducts: the case of Candida glabrata for α-ketoglutarate production

2025· article· en· W4416834937 sur OpenAlexvenueno aff
Pan Zhu, Yufei Li, Zihan Zhao, Xinyi Sun

Notice bibliographique

RevueBiofuel Research Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNatural Science Foundation of Jiangsu ProvinceGovernment of Jiangsu Province
Mots-clésTranscription factorCitric acid cycleMetabolic engineeringCandida glabrataMetabolic pathwayGlycolysisFlux (metallurgy)Transcription (linguistics)Metabolic flux analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

α-Ketoglutarate, a key intermediate in the TCA cycle, is crucial for amino acid synthesis and nitrogen transport. However, microbial engineering for α-ketoglutarate production is hindered by the intrinsic inefficiency of the metabolic network. In this study, transcription factor engineering was performed for the reconstruction of the metabolic network to boost α-ketoglutarate biosynthesis in Candida glabrata. Transcription factors GCR2 and RTG1 were first reinstalled to kick-start the glycolytic pathway and the TCA cycle, respectively, and then optimized to redistribute carbon flux between the two pathways. In addition, pyruvate carriers, MPC1 and MPC2, were introduced to facilitate the transport of cytoplasmic pyruvate to mitochondria, thereby feeding it into the TCA cycle for α-ketoglutarate biosynthesis. Next, transcription factor HAP4 was utilized to rewire the electron transport chain for improving redox balance and reducing overflow metabolism, thereby channeling more carbon flux to α-ketoglutarate production. Finally, the engineered strain C. glabrata KGA17 was capable of producing 210.4 g/L α-ketoglutarate in a 5-L bioreactor. This approach showed significant promise for developing efficient microbial cell factories for high-value chemical production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,079
Score d'incertitude au seuil0,286

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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