Short- and long-term dietary supplementation as well as withdrawal of the enteric methane inhibitor 3-nitrooxypropanol reveal distinct effects on the rumen microbial community
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The enteric methane inhibitor 3-nitrooxypropanol (3-NOP) inhibits the key enzyme in ruminal methanogenesis, but whether short-term (ST) and long-term (LT) dietary supplementation has similar effects on rumen microbiota in beef cattle and how microbes change after 3-NOP withdrawal have not been studied. This study investigated changes in rumen bacteria, archaea, and protozoa after ST and LT dietary supplementation and removal of 3-NOP using metataxonomic analysis. RESULTS: A total of 143 rumen samples were collected from two beef cattle studies with 3-NOP supplementation. The ST study (95 samples) used eight ruminally cannulated beef cattle in a 4 × 4 Latin square design with four 28-d of 3-NOP treatments [mg/kg of dry matter (DM)]: control: 0, low: 53, med: 161, and high: 345. The LT study (48 samples) was a completely randomized design with two 3-NOP treatments [control: 0, and high: 280 mg/kg of DM) fed for 112-d followed by a 16-d withdrawal (without 3-NOP). Bacterial and archaeal communities were significantly affected by 3-NOP supplementation but limited effects on protozoal communities were observed. Under ST supplementation, the relative abundances of Prevotella, Methanobrevibacter (Mbb.) ruminantium, Methanosphaera sp. ISO3-F5, and Entodinium were increased (Q < 0.05), whereas those of Mbb. gottschalkii and Epidinium were decreased (Q < 0.05) with 3-NOP supplementation. In LT study, relative abundances of Mbb. ruminantium, and Methanosphaera sp. Group5 were increased (Q < 0.05), while those of Saccharofermentans and Mbb. gottschalkii were decreased (Q < 0.05) with 3-NOP supplementation. Comparison between 3-NOP supplementation and the withdrawal revealed increased relative abundances of Clostridia UCG-014 and Oscillospiraceae NK4A214 group and decreased those of Eubacterium nodatum group and Methanosphaera sp. Group5 (P < 0.05) after 3-NOP withdrawal. Further comparison of rumen microbiota between control and 3-NOP withdrawal showed significantly higher (P = 0.029) relative abundances of Eggerthellaceae DNF00809, p-1088-a5 gut group, and Family XII UCG-001 in control group while no significant differences were detected for archaea and protozoa. Microbial network analysis revealed that microbial interactions differed by both 3-NOP dose and durations. CONCLUSIONS: Both ST and LT supplementation affected overall rumen microbial profile, with individual microbial groups responded to 3-NOP supplementation differently. After 3-NOP withdrawal, not all microbes showed recovery, indicating that the 3-NOP driven shifts were only partially reversible. These findings provide an understanding of the effects of 3-NOP on rumen microbial communities and their adaptability to methane mitigation strategies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».