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Enregistrement W4416916567 · doi:10.1038/s41699-025-00636-3

Proteoliposomes on 2D-MoS₂ plasmonic nanocavities for enhanced Raman spectroscopy with machine learning-based identification and classification

2025· article· en· W4416916567 sur OpenAlexafffund
Sajad Shiekh, Yueru Zhou, Carolina del Real Mata, Mahsa Jalali, Jackson McCormack-Ilersich, Imaan I. Hosseini, Zezhou Liu, Matheus Azevedo Silva Pessôa, Seyed Vahid Hamidi, Laura Montermini, Janusz Rak, Walter Reisner, Sara Mahshid

Notice bibliographique

Revuenpj 2D Materials and Applications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFondation Charles-BruneauCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research SocietyMcGill University Health CentreCanada Foundation for InnovationPolytechnique MontréalUniversité du Québec à MontréalMcGill University
Mots-clésSurface-enhanced Raman spectroscopyNanobiotechnologyExtracellular vesiclesRaman scatteringNucleic acidClassifier (UML)VesicleRaman spectroscopyPlasmonNanoparticle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synthetic proteoliposomes functionalized with disease-relevant surface markers offer a powerful platform for modeling biological vesicles such as lipid nanoparticles and extracellular vesicles. The simplified composition of proteoliposomes facilitates the design and interpretation of analytic approaches for classifying vesicles and characterizing their contents. Here, we present a library of synthetic proteoliposomes incorporating tumor-associated surface biomarkers—EGFR, α6β4, and αvβ5—and nucleic acid cargo, to mimic cancer-derived extracellular vesicle phenotypes. For molecular fingerprinting, we employed a custom-designed 2D-plasmonic nanocavity platform that enables high-resolution, label-free Surface-Enhanced Raman Spectroscopy (SERS). Integrated with supervised machine learning algorithms, including Random Forest Classifier (RFC) and Support Vector Machine (SVM), this system achieved robust classification of proteoliposome subtypes with test accuracies of 82% and 76%, respectively. Our results demonstrate the power of combining synthetic vesicle engineering with advanced optical sensing for capturing subtle biomolecular differences. This platform enables standardized, interpretable diagnostic readouts and offers a versatile tool for probing molecular interactions in lipid-based systems such as virus-like particles and nanotherapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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