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Enregistrement W4417067483 · doi:10.1016/j.fsi.2025.111059

Insights into American lobster (Homarus americanus) defence mechanisms against Vibrio splendidus

2025· article· en· W4417067483 sur OpenAlexafffund
Zohreh Fazelan, K. Fraser Clark

Notice bibliographique

RevueFish & Shellfish Immunology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Science Foundation
Mots-clésVibrioImmune systemGeneShellfishCrustaceanAmerican lobsterInnate immune systemImmunityVibrio Infections

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Members of the Vibrio genus are widespread, Gram-negative, facultatively anaerobic, heterotrophic bacteria that inhabit many aquatic environments and contribute to nutrient cycling. They display different lifestyles, living freely in the water column, residing in sediments, or forming associations with other organisms, including as constituents of the crustacean gut microbiota. While some Vibrio species form mutualistic symbioses, others act as pathogens, causing vibriosis and significant mortality in marine fish and/or shellfish populations. In this study, the American lobster (Homarus americanus) was able to defend itself against Vibrio splendidus, with no mortality observed during the challenge. We performed RNA-Seq analysis of the hepatopancreatic tissue, an important immune organ in crustaceans, to elucidate the molecular mechanisms of this defence response. The expression of over 21,000 genes was measured, where 1250 were identified as differentially expressed. Seventy-two of these differentially expressed genes were annotated as having a role related to host immune or stress response. Of particular significance is the differential expression of several anti-lipopolysaccharide factors (ALFs), pentraxin serum amyloid A-5 protein-like (SAA-5-like), crustacean hyperglycemic hormone (CHH) genes, and other genes involved in signalling pathways, coagulation, and antioxidant defence systems. The distinct regulation of individual ALF and lectin genes may suggest a tailored immune response to V. splendidus. These findings provide novel insights into the molecular mechanisms regulating immune responses in the American lobster and contribute to our broader understanding of host-pathogen interactions in marine crustaceans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,261
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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