Insights into American lobster (Homarus americanus) defence mechanisms against Vibrio splendidus
Notice bibliographique
Résumé
Members of the Vibrio genus are widespread, Gram-negative, facultatively anaerobic, heterotrophic bacteria that inhabit many aquatic environments and contribute to nutrient cycling. They display different lifestyles, living freely in the water column, residing in sediments, or forming associations with other organisms, including as constituents of the crustacean gut microbiota. While some Vibrio species form mutualistic symbioses, others act as pathogens, causing vibriosis and significant mortality in marine fish and/or shellfish populations. In this study, the American lobster (Homarus americanus) was able to defend itself against Vibrio splendidus, with no mortality observed during the challenge. We performed RNA-Seq analysis of the hepatopancreatic tissue, an important immune organ in crustaceans, to elucidate the molecular mechanisms of this defence response. The expression of over 21,000 genes was measured, where 1250 were identified as differentially expressed. Seventy-two of these differentially expressed genes were annotated as having a role related to host immune or stress response. Of particular significance is the differential expression of several anti-lipopolysaccharide factors (ALFs), pentraxin serum amyloid A-5 protein-like (SAA-5-like), crustacean hyperglycemic hormone (CHH) genes, and other genes involved in signalling pathways, coagulation, and antioxidant defence systems. The distinct regulation of individual ALF and lectin genes may suggest a tailored immune response to V. splendidus. These findings provide novel insights into the molecular mechanisms regulating immune responses in the American lobster and contribute to our broader understanding of host-pathogen interactions in marine crustaceans.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».