Gut microbiota's temporal dynamics and relationships with individual traits in a wild eastern chipmunk population
Notice bibliographique
Résumé
The composition and diversity of the gut microbiota are known to impact host biological processes, and variation among individuals is hypothesized to lead to differences in fitness. However, studies of the gut microbiota in natural contexts are still scarce, and the factors driving individual microbiota variation in wild populations remain unclear. In this study, we sampled the gut microbiota of wild eastern chipmunks (Tamias striatus) over two years to investigate host-related factors influencing microbiota α-diversity and composition. We assessed the relative contribution of individual identity and evaluated the stability of gut microbial communities. We amplified 16S rRNA gene sequences to quantify the bacterial community composition of 436 faecal samples. Our results revealed that juvenile chipmunks exhibited lower bacterial α-diversity compared to adults. Furthermore, the composition of the gut microbiota varied depending on chipmunk behavioural traits, where high exploration speed and centrality were linked to different microbial communities than those associated with trappability and trap diversity within an active season. Additionally, microbiota diversity was stable and highly individualized within a trapping season, though among-individual differences did not persist from one year to the next. Our findings support the relationship between gut microbiota and behaviour in wild mammals and add to the growing evidence that the individual signature of bacterial diversity and composition is time dependant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».