Mapping the genetic landscape across 14 psychiatric disorders
Notice bibliographique
Résumé
Psychiatric disorders display high levels of comorbidity and genetic overlap1,2, challenging current diagnostic boundaries. For disorders for which diagnostic separation has been most debated, such as schizophrenia and bipolar disorder3, genomic methods have revealed that the majority of genetic signal is shared4. While over a hundred pleiotropic loci have been identified by recent cross-disorder analyses5, the full scope of shared and disorder-specific genetic influences remains poorly defined. Here we addressed this gap by triangulating across a suite of cutting-edge statistical and functional genomic analyses applied to 14 childhood- and adult-onset psychiatric disorders (1,056,201 cases). Using genetic association data from common variants, we identified and characterized five underlying genomic factors that explained the majority of the genetic variance of the individual disorders (around 66% on average) and were associated with 238 pleiotropic loci. The two factors defined by (1) Schizophrenia and bipolar disorders (SB factor); and (2) major depression, PTSD and anxiety (Internalizing factor) showed high levels of polygenic overlap6 and local genetic correlation and very few disorder-specific loci. The genetic signal shared across all 14 disorders was enriched for broad biological processes (for example, transcriptional regulation), while more specific pathways were shared at the level of the individual factors. The shared genetic signal across the SB factor was substantially enriched in genes expressed in excitatory neurons, whereas the Internalizing factor was associated with oligodendrocyte biology. These observations may inform a more neurobiologically valid psychiatric nosology and implicate targets for therapeutic development designed to treat commonly occurring comorbid presentations. Genomic analyses applied to 14 childhood- and adult-onset psychiatric disorders identifies five underlying genomic factors that explain the majority of the genetic variance of the individual disorders.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».