Genomic architecture and evolution of heterostyly: new insights from <i>Cordia subcordata</i> (Boraginaceae)
Notice bibliographique
Résumé
Heterostyly is a floral polymorphism controlled by an S-locus supergene in several angiosperm families. Most heterostylous species are self-incompatible. Here, we investigate the genomic architecture of distyly in self-compatible Cordia subcordata in which incompatibility has apparently been lost. We assembled chromosome-level genomes of floral morphs and conducted population genomic analyses to locate the S-locus region. We used transcriptomic analyses of floral organs and functional validation by gene overexpression to identify genes controlling floral dimorphism. The tempo and mode of origin of S-locus genes was also investigated to determine whether gene duplication facilitated supergene assembly. The candidate S-locus in C. subcordata contained 12 genes, eight of which were restricted to the S-morph. CsGA2ox6 deactivates gibberellins and was exclusively expressed in S-morph pistils. Overexpression of CsGA2ox6 in transgenic tobacco produced flowers with shortened styles and an apparently functioning self-incompatibility system. The genomic locations of paralogs and estimations of duplication age suggested that the S-locus genes may have arisen through stepwise duplications, although an origin via segmental duplication could not be excluded. Our study revealed molecular convergence with several other distylous families in hemizygous structure and possibly in the mode of supergene origins. We also identified a molecular pathway for style-length control, likely through gibberellin deactivation by CsGA2ox6, which may have also controlled the expression of self-incompatibility in transgenic plants.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».