Astral-DIA proteomics and 4D label-free N-glycoproteomics of milk fat globule membrane proteins reveal distinct profiles between yak colostrum and mature milk
Notice bibliographique
Résumé
Milk fat globule membrane (MFGM) proteins are highly glycosylated and participate in various biological processes. However, the N-glycoproteomic profiles of MFGM protein in yak colostrum (YC) and mature milk (YM) remain unexplored. In this study, Astral data-independent acquisition proteomics was applied to analyze the MFGM proteomes of YC and YM, while 4D label-free quantification was used to investigate their N-glycoproteomes. A total of 4278 proteins were identified, of which 1271 were differentially expressed. Additionally, 89 N-glycoproteins, 120 N-glycopeptides, and 128 N-glycosylation sites were detected. Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analyses showed many MFGM proteins and N-glycoproteins involved in immune functions, mainly enriched in pathways such as complement and coagulation cascades, Fc gamma R-mediated phagocytosis, and hematopoietic cell lineage. Findings from this research offer unprecedented perspectives on the MFGM proteomes and their glycosylation in yak milk and support the development of functional dairy products.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».