Détection de Neisseria gonorrhoeae FC428 ayant l’allèle mosaïque penA60, non associé à des voyages et non sensible à la ceftriaxone en Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Contexte : Ce rapport décrit le cas d'un jeune homme atteint d'une infection à Neisseria gonorrhoeae multirésistante contractée en Ontario, au Canada, sans aucun antécédent de voyage.Méthodes : Le suivi de cas a été effectué conformément aux pratiques courantes de santé publique en Ontario.Les épreuves de sensibilité aux antimicrobiens des isolats ont été réalisés par dilution en gélose.Le typage de souche et d'autres caractérisations moléculaires ont été effectués par séquençage du génome entier.Résultats : Le patient a été traité avec succès avec de la ceftriaxone intramusculaire et de l'azithromycine par la voie orale.Les tests de dilution en gélose ont montré une sensibilité réduite à tous les agents testés, à l'exception de l'azithromycine et de la spectinomycine, y compris une non sensibilité à la ceftriaxone (concentration minimale inhibitrice [CMI] = 0,5 mg/L) et au céfixime (CMI = 2 mg/L), une résistance à la tétracycline (CMI = 2 mg/mL) et à la ciprofloxacine (CMI = 32 mg/L), et une sensibilité intermédiaire à la pénicilline (CMI = 1 mg/L).Le séquençage du génome entier a révélé que l'isolat était étroitement lié au clone FC428, qui héberge l'allèle mosaïque penA60 responsable des CMI élevées aux céphalosporines à spectre étendu, telles que la ceftriaxone ou la céfixime, toutes deux actuellement recommandées comme options de traitement de première intention ou de remplacement pour les infections de gonorrhée anogénitale sans complications en Ontario.Conclusion : L'identification de ce cas suggère qu'une transmission locale de cette souche de N. gonorrhoeae multirésistante, non reconnue auparavant, a lieu en Ontario et souligne la nécessité d'une surveillance continue afin de suivre les tendances et de guider les recommandations de traitement.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».