Genome-wide identification of GRF transcription factor in Populus: Regulatory analysis of the miR396-PagGRF1/2e-PagWUSa module in adventitious shoot regeneration
Notice bibliographique
Résumé
Growth-Regulating Factor (GRF) transcription factors are important regulators that promote adventitious shoot formation and improve genetic transformation efficiency in plants. Poplar ( Populus spp.), known for its rapid growth, is extensively applied in forestry improvement and biotechnology. Organ regeneration serves as the foundation for genetic improvement. The regeneration process in poplar is often regarded as being strongly genotype-dependent and characterized by prolonged regeneration periods. Here, we characterized 22 Pag GRF genes in the genome of '84 K' poplar ( Populus alba × P. glandulosa ) and performed a genome-wide survey to characterize their evolutionary relationships and gene features. Of these genes, Pag GRF1/2e was markedly upregulated during adventitious shoot regeneration. Overexpression of Pag GRF1/2e significantly promoted adventitious shoot regeneration. Whereas overexpression of miR396 strongly suppressed it. Further analysis revealed that PagGRF1/2e binds the Pag WUSa (WUSCHEL) promoter to induce its transcription, forming a regulatory module—miR396–PagGRF1/2e–Pag WUSa —that controls adventitious shoot regeneration in poplar. Overall, our study not only identifies Pag GRF1/2e as a positive regulator of shoot regeneration and provide a well-defined genetic module that could serve as a strategic target for improving regenerative and transformation efficiency in woody species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».