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Enregistrement W4417439551 · doi:10.1038/s44328-026-00098-7

Label-free optical observation of disordered-to-ordered transitions in single intrinsically disordered proteins

2025· article· en· W4417439551 sur OpenAlexaff
Saaman Zargarbashi, Cyril Dominguez, Matthew Peters, Arman Yousefi, Sharon Munday, Yanhong Wang, Shreyasi Chatterjee, Andrew J. Hudson, Reuven Gordon, Christopher J. Mellor, Lei Xu, Mohsen Rahmani, Cuifeng Ying

Notice bibliographique

Revuenpj Biosensing · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWolfson FoundationAcademy of Medical SciencesUK-India Education and Research InitiativeScheme for Promotion of Academic and Research CollaborationDirectorate for Biological SciencesRoyal Society
Mots-clésIntrinsically disordered proteinsOptical tweezersConformational changeProtein structureGlobular proteinLimitingConformational ensemblesFörster resonance energy transfer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intrinsically disordered proteins (IDPs) and structured proteins with intrinsically disordered regions (IDRs) lack a definitive tertiary structure and contribute to the onset of diseases such as Alzheimer's and cancer. To date, experimental observation of single, label-free IDPs/IDRs poses a significant challenge due to their structural heterogeneity, limiting ensemble techniques from fully capturing their properties, whilst single-molecule measurements require site-specific modifications or non-physiological conditions, perturbing their native biophysics. Here, we demonstrate the first experimental observation of unmodified IDP/IDR conformational dynamics at the single-molecule level, achieved by optical trapping and investigation of individual IDPs/IDRs using nanoaperture optical tweezers. Our results reveal that IDPs/IDRs exhibit significantly larger conformational variations compared to globular proteins of similar size. We demonstrate that phosphorylation of native tau-441 by glycogen synthase kinase 3-beta (GSK3β-tau) induces compaction and reduced conformational dynamics. We further observed a disorder-to-order transition during the binding of the N-terminal region of the Src-associated protein in mitosis of 68 kDa (Sam68) to G8.5 RNA. These findings present nanoaperture optical tweezers as a powerful approach to advance our understanding of IDPs/IDRs and further decode their roles in associated diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,800

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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