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Enregistrement W4417472385 · doi:10.1109/nss/mic/rtsd57106.2025.11287275

YRT-PET-NX: Development of a Plugin for an Open-Source PET Reconstruction Platform to Support the NeuroEXPLORER

2025· article· W4417472385 sur OpenAlexaff
Yassir Najmaoui, Kathryn Fontaine, David Fontaine, Jing Zhang, Tao Zeng, Tommaso Volpi, Yanis Chemli, J.-D. Gallezot, Marc‐André Tétrault, Richard E. Carson, Georges El Fakhri, Thibault Marin

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging Techniques and Applications
Établissements canadiensInstitut interdisciplinaire d'innovation technologiqueUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésPlug-inIterative reconstructionSoftwareImage resolutionDetectorVendorImage processing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ultra-high resolution PET scanners offer multiple benefits to brain imaging for researchers and clinicians. The NeuroEXPLORER (NX) scanner, a brain-dedicated PET system with high resolution and high sensitivity, achieves exceptional image quality. These benefits, however, introduce challenges for image reconstruction in terms of speed, memory usage and need for accurate system modeling and motion correction. Open-source third-party image reconstruction tools can be a valuable substitute to manufacturer software to address these challenges, as well as to enable the evaluation of different modeling approaches and algorithms. In this work, the opensource PET reconstruction platform YRT-PET (Yale Reconstruction Toolkit for Positron Emission Tomography) is extended through a plugin to support the NX scanner. YRT-PET provides a scanner-agnostic reconstruction platform with research-oriented features. The YRT-PET-NX plugin integrates detector geometry, listmode packet decoding and scanner-specific corrections. We evaluated the performance by reconstructing a mini-Derenzo phantom, a non-human primate, and a human brain, comparing YRT-PET results with those from the vendor software and the MOLAR engine. Based on the mini-Derenzo reconstructions, comparable resolution was achieved, with a slight gain in peak-to-valley ratios. Across both non-human primate and human datasets, YRT-PET produced nearly-identical images. Time-activity curves for the non-human primate were quantitatively consistant, with a 5 - to 18 -fold reduction in reconstruction time due to GPU acceleration. These results demonstrate that the YRT-PET-NX plugin enables efficient and highquality reconstructions comparable to preexisting and established software. This work enables the features of YRT-PET alongside the high resolution of the NX. Future work aims to expand support for additional corrections such as randoms and scatter estimation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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