A liver gene signature links liver cancer risk in chronic viral hepatitis to intrahepatic IgA plasma cells
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND & AIMS: Chronic viral hepatitis remains a leading cause of liver cancer-related mortality worldwide. We aimed to identify genetic markers associated with hepatocellular carcinoma (HCC) risk in precancerous liver biopsies from patients with chronic HBV or HCV infection. METHODS: We conducted a multicenter nested case-control study including biopsied patients with chronic viral hepatitis from eight hospitals across Europe and Canada. Cases developed HCC a median of 7.1 years (range 1.5-26.8) after baseline liver biopsy, irrespective of antiviral treatment initiation, and were matched to controls by age, sex, infecting virus, fibrosis stage, and follow-up duration. A semi-supervised machine-learning approach was applied to liver RNA sequencing data, with de novo HCC development as the outcome. Immunohistochemistry and serum analyses were performed on available samples. RESULTS: ) and the validation cohort (p = 0.032). The signature was externally validated for de novo HCC (n = 216; p = 0.048) and for HCC recurrence in patients with cirrhosis irrespective of viral etiology (n = 82; p = 0.026; n = 228; p = 0.030). Single-cell modular score analyses indicated that the HCC risk signature reflects fibrovascular tissue expansion, hepatocyte loss, and increased transcriptional activity of IgA-producing plasma cells. The latter correlated with periportal IgA protein staining in paired transcriptomic-immunohistochemistry analyses. In a small subcohort, serum IgA levels also correlated with liver gene expression, suggesting potential utility as a surrogate marker of liver tissue architecture. CONCLUSIONS: A 557-gene liver transcriptomic signature, including IgA plasma cell-related transcripts, identified in pretreatment liver biopsies from patients with chronic HBV or HCV infection, is associated with future HCC risk. IMPACT AND IMPLICATIONS: Chronic viral hepatitis remains a major global cause of hepatocellular carcinoma (HCC)-related mortality, underscoring the need for improved risk stratification strategies. We identified a 557-gene liver transcriptomic signature, including IgA plasma cell-related transcripts, in pretreatment liver biopsies from patients with chronic hepatitis B and C that is associated with future HCC development. The expression of IgA plasma cell transcripts correlated with periportal IgA protein deposition in liver tissue, supporting their biological relevance. These findings highlight a previously underappreciated association between intrahepatic IgA plasma cells and hepatocarcinogenesis and warrant further investigation into their mechanistic role and potential utility as biomarkers or therapeutic targets for HCC.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
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