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Enregistrement W4417521185 · doi:10.1038/s41598-025-33151-y

Altered PTPN13–β-catenin interaction by pathogenic mutations and involvement of this axis in B-cell receptor signalling

2025· article· en· W4417521185 sur OpenAlexaff
David A. Cabrera-Riofrío, Hongbing Li, Clara García-Calvo, Carmen Sánchez‐Bernal, Jesús Sánchez‐Yagüe, Yigal Dror, Rubén M. Buey, Ángel Hernández‐Hernández

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónBanco Santander
Mots-clésProtein tyrosine phosphataseGene silencingRegulatorHaematopoiesisReceptor tyrosine kinaseTyrosine kinaseSignallingEffector

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 (PTPN13) is a non-receptor protein tyrosine phosphatase with context-dependent roles as tumour suppressor or promoter. Its modular structure supports multiple molecular interactions, including a critical one with β-catenin, a regulator of the haematopoietic system. We previously identified three pathogenic PTPN13 mutations in families with acute lymphoblastic leukaemia (ALL), anaemia, and/or inherited bone marrow failure (IBMF). Our current findings reveal that these mutations impair the PTPN13-β-catenin interaction. β-catenin and PTPN13 are stabilised upon B-cell receptor (BCR) activation, while PTPN13 silencing reduces Bruton's tyrosine kinase (BTK) activation and β-catenin levels, indicating that PTPN13 modulates BCR signalling at multiple points. Together with prior evidence showing that PTPN13 mutations compromise protein stability and decrease β-catenin levels, these data support a role for disrupted lymphoid signalling. Altered expression of key surface markers (CD25 and CD38) upon silencing of either PTPN13 or β-catenin further supports this interpretation. In conclusion, our study identifies the PTPN13-β-catenin axis as a critical regulator of lymphoid cell homeostasis and highlights its disruption as a potential driver of haematological abnormalities in patients carrying PTPN13 mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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