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Enregistrement W53192118 · doi:10.1096/fasebj.21.6.a975-c

Human Neutrophils produce alternatively spliced variants of 5‐Lipoxygenase mRNA

2007· article· en· W53192118 sur OpenAlexafffundabout
Luc H. Boudreau, Jonathan Bertin, Marc E. Surette

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research Chairs
Mots-clésGene isoformAlternative splicingMessenger RNAIntronMolecular biologyExonBiochemistryOpen reading frameBiologyArachidonic acidArachidonate 5-lipoxygenaseBiosynthesisRNA splicingLipoxygenaseEnzymeChemistryGeneRNAPeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

5-lipoxygenase (5-LO) catalyzes the oxygenation of the 5th carbon on arachidonic acid and is, therefore, an essential enzyme for leukotriene biosynthesis. Activation of the 5-LO pathway following the stimulation of human neutrophils (PMN) leads to the formation of LTB4, a potent chemoattractant involved in the inflammatory response. Our studies focus on the mechanisms by which the biosynthesis of 5-LO products is controlled. In this study, we evaluated whether alternative forms of 5-LO mRNA exist in human PMN. Following reverse transcription and PCR analyses of total mRNA extracted from PMN isolated from peripheral blood, several potential variants of 5-LO mRNA were identified. Molecular cloning and sequencing experiments revealed that at least two isoforms are present in human PMN: one containing all 14 exons with the expected splicing sites and one that results from the inclusion of intron 10. Approximately 20% of generated clones contained this variant isoform. Treatment of human PMN with granulocyte-macrophage colony stimulating factor (GM-CSF) did not result in the appearance of new isoforms. The retention of intron 10 in the mRNA produces a frame shift in the open reading frame and the immediate appearance of the stop codon TGA. Experiments are underway to determine whether the translation product of the alternative isoform impacts on the capacity for the biosynthesis of 5-LO products. (Supported by the Canadian Institutes of Health Research and the Canada Research Chairs Program)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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