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Enregistrement W570568108 · doi:10.1093/cdn/nzy042

Methods and Protocols

2018· article· en· W570568108 sur OpenAlexafffund
Donald Armstrong

Notice bibliographique

RevueCurrent Developments in Nutrition · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of WaterlooUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsNational Institutes of HealthUniversity of Guelph
Mots-clésComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives: Avocatin B is a mixture of two 17-carbon polyhydroxylated fatty alcohols (PFAs): avocadene (1,2,4-trihydroxyheptadec-16-ene; C 17 H 34 O 3 ) and avocadyne (1,2,4trihydroxyheptadec-16-yne; C 17 H 32 O 3 ).First discovered in avocado seed, their quantity in pulp is unknown.Analytical methods to detect avocado seed PFAs have utilized nuclear magnetic resonance spectroscopy and GC-MS, both of which are limited in quantitative capacity, sensitivity, and accuracy.The objective of this study was to develop and validate an LC-MS method to detect and quantify amounts of avocadene and avocadyne in Hass avocado seed and pulp matter.Method: A commercially available standard of avocatin B was used to ascertain the exact mass of avocadene and avocadyne molecular ions (MS) and their subsequent fragmentation (MS/MS) in positive electrospray ionization mode in a high-resolution quadrupole-orbitrap mass spectrometer.The fragmentation peaks [M + H -H 2 O] + of avocadene and avocadyne were most intense and enabled the development of a sensitive high mass resolution UHPLC-MS method for quantification. Results:The method has a reliable and linear response range of 0.1-50 µM (0.03-17.2 ng/µL) for both avocadene and avocadyne (r 2 > 0.990) with a lower limit of quantitation (LLOQ) of 0.1 µM.The intra-and interassay accuracy and precision of the quality control (QC) samples at LLOQ showed ≤18.2% percentage error and ≤14.4% coefficient of variation (CV).The intraand interassay accuracy and precision for QC samples at low and high concentrations were well below 10% percentage error and CV.This method was successfully applied to quantify avocadene and avocadyne in total lipid extracts of Hass avocado pulp and seed matter.The results showed that the average amounts in the dry weight of one Hass avocado pulp and seed, respectively, were 59.05 ± 16.40 and 60.35 ± 30.23 mg for avocadyne and 117.50 ± 52.53 and 70.92 ± 31.69 mg for avocadene.Conclusions: Avocatin B possesses potent anticancer activity by selectively targeting and eliminating leukemia stem cells.This work demonstrates that avocadene and avocadyne are found in appreciable quantities in pulp and seeds of Hass avocados, the most cultivated and widely consumed variety of avocados in the world.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,144
Score d'incertitude au seuil0,483

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0060,003
Études des sciences et des technologies0,0060,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0070,003
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1440,133

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,363 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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